腹部肿瘤外科以胃癌、结肠癌、直肠癌、胆道胰腺肿瘤等腹部肿瘤外科规范化诊治为主的品牌科室，兼治各种普外科良性疾病，其中胃肠肿瘤外科为江西省医学领先学科。腹部肿瘤外科共三个病区，开放病床156张，医护人员69名，其中主任医师6人，副主任医师2人，主治医师13人，住院医师2人，科室硕士及以上学历者21人，其中博士8人，护士46人。
科室坚持技术创新、锐意进取，不断加强对外交流学习，近年派出多名医师赴国内外知名医院（美国麻省总医院、日本长崎大学医学中心、意大利国家癌症中心等）交流学习。近5年主持国家自然科学基金6项，省自然科学基金6项，省科技厅、省卫生厅课题30余项，发表SCI论文30余篇。承担本科生、硕士研究生以及进修医生的临床教学工作。
科室近年来举办多期国家级继续教育项目培训班，包括胃肠癌规范化诊治全省巡讲及腹腔镜胃肠癌手术直播，成效显著，为全省推广胃肠胆胰肿瘤规范化诊治及微创治疗技术起到重要作用。
为江西省抗癌协会大肠癌专业委员会、江西省抗癌协会MDT专业委员会挂靠科室，科室技术力量雄厚，学术梯队健全，胃肠肿瘤和胆胰肿瘤外科技术及疗效居省内领先水平、国内先进水平，手术量居全省前列。
